中医把各种致病因素分为三类：
第一类是所谓“内因”，主要指精神情志方面的变动，包括喜、怒、忧、思、悲、恐、惊等“七情”。正常的情志活动并不致病。如果出现强烈的情志变化，则可造成机体生理功能失调，引起心身疾病。
由于气功的重要手段之一是调神，调整心理状态，因此心身疾病是气功的第一类适应症。如原发性高血压、冠心病、心律失常、心脏神经官能症、昏厥、哮喘、消化性溃疡、神经性厌食、溃疡性结肠炎、慢性结肠炎、慢性胰腺炎、神经性呕吐、偏头痛、腰背痛、糖尿病、湿疹、类风湿性关节炎、癌肿、痛经、月经不调、等等。“七情”的极端变化均可引起这些病的发生或加剧。气功锻炼对这些病有较好的疗效，甚至有的病只用气功治疗便可痊愈。气功具有治疗疾病巩固疗效、防止复发的作用。
第二类致病因素是“外因”，它包括风、寒、暑、燥、湿、火，中医称之为“六淫”以及疫疠（传染病）等。
第三类是“不内外因”，它主要包括饮食起居和房室劳倦等。
对这后两类病因引起的机体功能失调疾病，气功亦有一定的疗效。我们知道，所有外因都是通过内因来起作用的，治病因素作用于人体后能否引起疾病，取决于人体的防御机能、免疫能力，即“正气”的强弱。
国医学认为，致病因素是在机体正气虚弱的情况下才会发生作用的，即所谓“邪之所凑，其气必虚”。而“七情”平稳则“正气内存，邪不可干”，“精神内守，病安从来”。气功锻炼能增强人的体质，提高机体免疫力，培育正气，使机体功能保持协调，创造一个好的内环境，因而也能够预防和治疗后两类致病因素所引起的疾病。
患有某些器质性疾病的患者，往往伴有紧张、忧愁等情志变化，通过气功锻炼也可改善患者的情志障碍，并进一步通过心理—生理—形态反应环节使病变的实质得到一定程度的修复。所以对器质性病变多可选用以其它疗法为主，辅以气功疗法的方式。
总之，气功疗法可对心理障碍、功能失调及某些器质性病变分别发挥不同的作用，但也并不象有的人宣传的那样，似乎气功可以包治百病并可迅速见效。
其实气功是需长期修练的。一些江湖气功师，不分病情轻重，要求患者一律停止其它治疗，只用气功治疗，这是极不妥当的。对于一些重病、久病病人，由于初接触气功，对其功理、功法一时不能熟练地掌握，可把气功作为一种辅助治疗手段，等患者摸到门道，逐渐熟练掌握了练功方法并有了疗效后，才可酌情确定气功在以后治疗中的主、辅位置。
