用于治疗痢疾泄泻
对兼有里急后重、腹部胀闷者更适宜。一般认为煨用较好，但不经煨用者也有效。
对肠道的作用
木香水提液、挥发油和总生物碱对小鼠离体小肠先有轻度兴奋作用，随后紧张性与节律性明显降低。对乙酰胆碱、组胺与氯化钡所致肠肌痉挛有对抗作用。小剂量煎剂对离体小肠的作用无一定规律性，大剂量则呈抑制作用。挥发油亦可抑制离体兔小肠运动，使其节律变慢，收缩不规则。去内酯挥发油、总内酯以及木香内酯、二氢木香内酯挥发油与二氢木香内酯作用较强。
功效主治
行气调中。本品味辛苦，性温，辛散温通，苦降，其味辛香走窜，可升可降。入脾、肝、胃经，脾主升，胃主降，肝主疏泄，而调畅气机。故本品能行气调中，用于中焦气滞之证，行脾胃气滞，而行气止痛，脾主运化，胃主受纳，二者升清，降浊，相辅相成，并依靠肝的疏泄调气机的功能。由于风寒等外邪侵入，或饮食不节，或七情所伤，而致脾胃的失降，运化功能及肝的疏泄功能失职，气机升降失常，气行不畅，阻于中焦，出现脘腹攻痛或窜痛，痞胀，闷满，食欲不振等症，本品辛香走窜，温通苦泄，疏通气机.行气通腑，通则不痛，为行气调中的佳品。
活血通络。本品辛散温通，其色赤，故入血分、可活血散瘀。脾统血，主四肢、肝藏血，主筋，故可活血通络，用于风寒痹痛，血瘀疼痛等证。对于各种原因引起的气血运行不畅而出现的瘀血痛经，闭经，腹痛，跌打损伤，以及风寒湿邪客于经脉，留滞于筋骨关节，气血瘀滞的关节痹痛等证，可活血行瘀，通络而止痛，因其性温，从寒邪内侵者最为适宜。
利尿通淋。《神农本草经》日木香：“主邪气，辟毒疫，主淋露。”木香味辛性温、辛散行气，性温可通，有理气通淋之功。用于气淋之证最宜。气滞淋证多由湿热内阻，气滞不通所致，小便涩滞，脐下胀满疼痛特甚，舌苔薄白，脉象沉弦，治用木香理气通淋，气行滞消，小便自通。
辟毒消恶。如《神农本草经》曰：“木香，辟毒疫。”《本草经集注》曰： “消恶气。”治瘴气，如感受山岚雾露湿热郁蒸之毒气后，表现寒热交作，神志昏迷，或声音哑，治用木香有御瘴雾，消恶气之效。《本草从新》曰：“木香杀鬼物，循瘴雾，去腋臭。”
